O SIAFI é o principal instrumento utilizado para registro, acompanhamento e controle da execução orçamentária, financeira e patrimonial do Governo Federal. Um de seus principais objetivos é padronizar métodos e rotinas de trabalho relativas à gestão dos recursos públicos, implicando maior rigidez e algumas restrições a essa atividade, mesmo permanecendo o SIAFI sob total controle do ordenador de despesa de cada unidade gestora.