Constituem antibióticos de primeira escolha para diversas situações clínicas em odontologia a amoxicilina e os macrolídeos.

A associação de amoxilina e ácido clavulínico é recomendada como primeira escolha na maioria dos casos clínicos em odontologia.

A clindamicina pode substituir a amoxicilina em casos de alergia a este antibiótico.

A profilaxia da endocardite infecciosa requer de 2 g a 3 g de amoxicilina em dose única, uma hora antes da intervenção.