a abertura da fita de DNA que servirá de molde, por desnaturação térmica tem duração entre 30s e 1min. a temperatura de 92-96 °C.

o pareamento de oligonucleotídeos sintéticos, que funciona como os iniciadores da reação de polimerização, a cada uma das fitas do DNA molde, à região complementar da fita que sofrerá a duplicação, tem duração de 2 dias a temperatura entre 58 e 65 °C.

a polimerização, através de uma enzima polimerase, das novas fitas de DNA a partir de cada um dos iniciadores, utilizando cada um dos quatro dNTP como substrato da reação de polimerização, tem duração entre 4 horas, a 72 °C.

o PCR promove, in vitro, por meio de variação de temperatura, o que o organismo realiza naturalmente, em condições fisiológicas − a duplicação de cadeias de DNA, envolvendo nucleotídeos, enzima polimerases e não é necessária a utilização de primers.

cada ciclo é repetido somente 1 vez e promove a amplificação da região alvo determinada conforme afinidade das sequencias iniciadoras (primers).