O Granuloma Periapical é assim denominado por se tratar de uma inflamação granulomatosa verdadeira demonstrada microscopicamente.

Pode originar-se após a estabilização de um abscesso periapical, mas não é uma lesão necessariamente estática, além da possibilidade da formação de cistos periapicais pode haver também o reaparecimento de inflamação aguda secundária, conhecida como abscesso fênix.

Nos estágios iniciais da infecção, há predominância de linfócitos e alterações radiográficas bastante evidentes, posteriormente ocorre a ação dos neutrófilos e osteoclastos responsáveis pela reabsorção óssea circundante.