Técnicas de fisioterapia respiratória são pouco eficazes para o tratamento de atelectasia pulmonar de pacientes em ventilação mecânica, sendo indicadas em situações muito específicas.

Na ausência de contraindicações, deve-se manter o decúbito elevado (entre 30 e 45°) em pacientes em ventilação mecânica, como estratégia de prevenção de pneumonia associada a ventilação mecânica (PAV).

A aspiração traqueal deve ser rotineira e realizada de quatro a seis vezes ao dia, enquanto o paciente se encontrar em ventilação mecânica invasiva ou não invasiva.

A hiperoxigenação (FIO2 = 1) pré-aspiração traqueal, com o objetivo de minimizar a hipoxemia, somente deve ser utilizada em indivíduos portadores de patologia restritiva.

A hiperinsuflação manual pode ser utilizada com segurança em portadores de doença pulmonar obstrutiva crônica (DPOC), desde que com pressão limitada em 50 cm H₂O.