O processo aeróbio gera biogás que pode ser aproveitado como fonte de energia.

Os sistemas anaeróbios apresentam maior dependência de aparelhos e consumo energético que os aeróbios.

A estabilização da matéria orgânica é mais rápida no processo anaeróbio do que no aeróbio.

A produção de lodo no reator anaeróbio é menor do que no reator aeróbio.

Os custos de implantação de um sistema aeróbio podem chegar à metade daqueles associados à implantação de um sistema anaeróbio.