O CME Classe I é aquele que realiza o processamento de produtos para a saúde não-críticos, semicríticos e críticos de conformação não complexa, passíveis de processamento.

O CME Classe II é aquele que realiza o processamento de produtos para a saúde não-críticos, semicríticos e críticos de conformação complexa e não complexa, passíveis de processamento.

O CME só pode processar produtos compatíveis com a sua capacidade técnica operacional e conforme a sua classificação (Classe I e II), no entanto, o CME Classe I pode processar produtos complexos apenas em casos de urgência/emergência.

É obrigatório que o CME Classe II possua, minimamente: sala de recepção e limpeza (setor sujo); sala de preparo e esterilização (setor limpo); sala de desinfecção química, quando aplicável (setor limpo); área de monitoramento do processo de esterilização (setor limpo); e sala de armazenamento e distribuição de materiais esterilizados (setor limpo).

O CME Classe I deve possuir, no mínimo, barreira técnica entre o setor sujo e os setores limpos, sendo que barreira técnica é entendida como um conjunto de medidas comportamentais dos profissionais de saúde visando a prevenção de contaminação cruzada entre o ambiente sujo e o ambiente limpo, na ausência de barreiras físicas.