De acordo com os estudos sobre o manejo integrado às fitomoléstias, a Teoria da Trofobiose se apresenta como um marco para o desenvolvimento da agroecologia. A explicação técnica dessa teoria baseia-se nos fatores ligados ao estado fisiológico da planta. A proteossíntese oferece uma maior resistência orgânica das plantas, e a proteólise, uma maior suscetibilidade. Em função disso, chegou-se à conclusão de que existem fatores que interferem na resistência orgânica das plantas, pois influem no metabolismo destas. Esse tipo de resistência orgânica também pode ser definida como regulação ou princípio pelo qual se previne doença pela manipulação do fator ambiental.

Baseando-se nesta visão, a resistência orgânica das plantas poderá ser aumentada em função dos seguintes fatores ambientais: