A RM agregou muitas informações ao diagnóstico etiológico das epilepsias.

Ambas têm semelhante sensibilidade na detecção das neoplasias cerebrais, com a vantagem da TC em demonstrar lesões com calcificações.

A TC é o exame de maior indicação nas emergências por ser rápido, disponível e ter grande sensibilidade para todas as lesões agudas, mas a RM com difusão é muito mais sensível na detecção precoce dos infartos cerebrais agudos.

Imagens de RM em T1 fornecem melhor definição anatômica e, assim como em FLAIR, o líquor aparece em cor escura. Em FLAIR, as desmielinizações são bem visualizadas, mas as lesões com alto conteúdo de água não.

A TC é muito sensível aos sangramentos agudos. Uma TC normal praticamente descarta qualquer tipo de hemorragia intracraniana.