Mesmo utilizando a ETE, ela continua dependendo das janelas torácicas do paciente para obtenção de uma imagem ótima.

Mesmo na ETE, para a obtenção de imagens em alguns cortes anatômicos, faz-se necessário mobilizar o paciente.

A ETE, em relação à ETT, não tem as imagens das cavidades cardíacas invertidas.

Para a utilização da ETE durante uma cirúrgica cardíaca, ela deve ser inserida antes da heparinização do paciente e retirada logo após sua normalização.

Quando temos ambas as modalidades disponíveis no centro cirúrgico para realização de uma cirurgia cardíaca (tanto ETT quanto ETE disponíveis), não havendo contraindicações, ainda se prefere o uso da ETT pela rapidez, facilidade de realização do exame e baixa invasividade.