A bexiga natatória, que pode ser preenchida ou esvaziada para regular a flutuabilidade, na maioria dos peixes, é um órgão cheio de gás que pode ser localizado ao longo da parede ventral da cavidade peritoneal e tem função hidrostática.

As brânquias são os órgãos respiratórios primários em todos os peixes e servem para absorver oxigênio, excretar ureia e regular o balanço de água e íons.

A linha lateral se origina na cabeça, ao redor dos olhos e narinas, e se estende ao longo da parede lateral do corpo, servindo como estrutura mecanosensorial, e é usada para detectar mudanças de temperatura e salinidade na água.

Os peixes são cobertos por uma camada mucosa que é parte importante do sistema imunológico inato e serve como a primeira linha de defesa contra organismos patogênicos.

Os peixes herbívoros apresentam o trato digestório, geralmente, muito mais longo do que os omnívoros e os carnívoros, e, em algumas espécies, o estômago é tripartido.