O transplante de pele é uma técnica simples e barata de monitorização genética. Em caso de rejeição, é possível, por essa técnica, determinar a diferença existente entre os indivíduos.

O transplante de pele entre indivíduos de uma mesma linhagem isogênica é aceito para detectar contaminação de uma linhagem, uma vez que todos os indivíduos devem ser geneticamente idêntico, e, portanto, histocompatíveis.

As técnicas mais novas, utilizando microssatélites ou SNPs, são caras e não têm apresentado bons resultados para diferenciação de integridade genética de linhagens isogênicas.

Os marcadores imunológicos são detectados por teste sorológicos. Essa é, atualmente, a técnica mais eficiente para o monitorização genética.

Os testes de citotoxicidade, hemaglutinação e citometria de fluxo não devem ser usados para monitorização genética.