Para diagnóstico de cistite aguda, é indispensável a presença dos sintomas urinários e exame de urocultura positivo para crescimento bacteriano com contagem de colônias >100.000 UFC/ml.

As pielonefrites agudas são causadas pela ascenção de bactérias via trato urinário baixo, exceto no caso do S. aureus, cuja via é a hematogênica.

Infecções virais por adenovírus são uma causa comum de infecção do trato urinário principalmente em mulheres acima de 60 anos.

Mulheres com até sete episódios de cistite por ano não são candidatas a terapia profilática antibiótica, por se tratar de condição comum relacionada à atividade sexual.