Clinicamente, as disfagias orofaríngeas podem se manifestar por meio de uma série de sintomas, tais como dificuldade em iniciar a deglutição, regurgitação nasal, controle de saliva diminuído, tosse e engasgos durante as refeições.

As evidências clínicas das disfagias orofaríngeas são sutis e os indícios de uma provável disfunção aparecem durante a entrevista em comentários como aumento do peso lento e gradual devido ao tempo de refeição prolongado.

O exame videofluorográfico é considerado bastante sensível na avaliação do paciente, identificando topograficamente a desordem neurológica causadora da disfagia.

É comum haver, nos quadros neurogênicos, um aumento da sensibilidade e do reflexo de tosse, além de comprometimento cognitivo, prejudicando a percepção e a demonstração do problema.