Trata-se do protótipo de doença autoimune, de etiologia idiopática, evoluindo para o desenvolvimento de linfócitos B autorreativos e produção de auto-anticorpos, sem outros defeitos nos demais segmentos do sistema imune

Fatores ambientes e infecções podem raramente se relacionar com o desenvolvimento da doença, sendo as alterações genéticas e histórico familiar os seus principais determinantes

Trata-se de doença complexa, com diversos defeitos no sistema imune levando à perda da auto-tolerância, com desenvolvimento de autoanticorpos e resposta imune contra antígenos self, mas também com distúrbios em mecanismos regulatórios, de apresentação e vias de sinalização, sistema complemento, entre outros

A influência e papel dos hormônios na fisiopatologia do Lupus se baseia na hipótese de imunomodulação, tendo o estrógeno papel estimulador de vários tipos celulares e citocinas do sistema imune, o que explica a maior incidência da doença em mulheres após a menopausa

As alterações genéticas relacionadas ao Lupus se caracterizam por caráter poligênico, com mais de 50 loci relacionados à uma maior predisposição. Na maioria dos pacientes com Lupus os principais genes relacionados com a produção e sinalização do interferon estão diminuídos (“assinatura de Interferon”)