Tanto o glutaraldeído, quanto o ácido peracético e o orthophtalaldeído produzem dano no meio ambiente.

O ácido peracético tem a vantagem sobre o glutaraldeído por não fixar proteínas.

Tanto o ácido peracético quanto o glutaraldeído não precisam ser inativados antes de serem desprezados no meio ambiente.

O ácido peracético e o orthophtalaldeído, assim como o glutaraldeído, requerem sistema de exaustão.