O FAT16 deriva do fato de que cada posição no disco utiliza uma área variável de 16 bits.

O FAT32, apesar de ser uma evolução do FAT16, era muito lento, em torno de 6% mais lento que o FAT16.

Um dos grandes problemas do FAT16 é que não era compatível com discos acima de 16 GB.

No FAT32, não é possível ter partições maiores do que 32 GB.

O NTFS é o sistema de arquivos mais seguro, possui recursos de recuperação de erros no disco, suporte para discos rígidos de maior capacidade, suporte para configuração de permissões e criptografia.