A digoxina é extensamente metabolizada nos seres humanos, sendo que pequena parte é excretada de modo inalterado pelos rins, e sua depuração renal diminui em pacientes com doença renal.

É um glicosídio cardíaco ou cardenolídio que combina um núcleo esteróide com um anel lactona insaturado de cinco membros na posição 17 e uma série de açúcares ligados ao carbono 3 do núcleo.

A digoxina é razoavelmente bem absorvida após administração oral, porém cerca de 10% dos indivíduos abrigam bactérias entéricas que inativam a digoxina no intestino, diminuindo sua biodisponibilidade.

Uma vez absorvidos no sangue, todos os glicosídios cardíacos distribuem-se amplamente pelos tecidos, incluindo o sistema nervoso central, entretanto seus volumes de distribuição diferem.