Algumas neoplasias benignas têm uma predileção anatômica específica, no entanto, a localização de uma neoplasia não é considerada uma característica importante para estabelecer um diagnóstico diferencial.

O epicentro de um cisto dentígero é encontrado lateralmente à coroa do dente envolvido, mais comumente um terceiro molar inferior ou superior ou um canino superior.

Uma alteração no contorno do folículo coronal à junção cemento-esmalte em um queratocisto não pode ser considerada uma característica radiográfica que o diferencie de um cisto dentígero.

Os cistos que surgem centralmente no osso têm uma periferia bem definida e cortical definida por uma linha radiopaca bastante uniforme e fina.

A medida que uma neoplasia benigna aumenta, ela pode deslocar suas estruturas vizinhas. Se o padrão de crescimento for indolente ou lento, as estruturas adjacentes podem apresentar-se destruídas.