A urina de indivíduos saudáveis normalmente é estéril, mas podem adquirir micro-organismos da flora normal. É por esse motivo que a coleta da amostra nem sempre exige o descarte do primeiro jato urinário.

Durante a urocultura, uma alça calibrada deve ser utilizada no semeio, sendo indicativo de bacteremia uma contagem de ao menos 10.000/ml.

As causas mais frequentes de infecção do trato urinário traz a presença da E. coli, podendo ainda apresentar a Enterobacter proteus e a Enterococcus faecalis.

No exame de urina de rotina, a técnica de Gram é indicada para identificar vários tipos de cilindros, com exceção dos cilindros bacterianos.