A metodologia a ser utilizada por um grupo popular explorado e desorganizado contra um adversário forte deve ser distinta da utilizada por um grupo popular forte e organizado contra o mesmo adversário.

Essa abordagem, apesar de sua dimensão participativa, não se propõe a superar a tensão contínua entre o processo de geração de conhecimento e o uso desse conhecimento.

Para sua realização, devem-se adotar posturas qualitativas e hermenêuticas, além da comunicação interpessoal, em vez de métodos tradicionais de coleta de dados, uma vez que esse tipo de pesquisa representa uma ruptura com a pesquisa tradicional.

O processo de pesquisa participante não se encerra na quarta fase, ou seja, com a análise crítica da realidade e a execução das ações programadas.

Apesar de promover a participação de grupos populares na produção do conhecimento, esse tipo de pesquisa não implica a prática de uma ciência modesta, que tenha por finalidade propiciar a realização das tarefas científicas nas condições mais adversas, insatisfatórias e primitivas mediante o uso de recursos locais.