Biomarcadores são importantes para seleção de pacientes e avaliação prognóstica. A deleção do cromossoma 18q está associada ao aumento do risco de recorrência de câncer de cólon EC II. Além disso, a presença da mutação K-ras está associada a resistência a anticorpos anti-EGFR. A expressão dos níveis de timidilato sintetase ERCC-1 pode predizer melhora de resposta ao regime quimioterápico FOLFIRI.