O farmacêutico poderá modificar a prescrição do paciente caso os medicamentos prescritos não estejam previstos em programas, protocolos e diretrizes aprovados para uso no âmbito de instituições de saúde do SUS.

Entre os analgésicos e anti-inflamatórios permitidos para prescrição farmacêutica, encontram-se paracetamol, naproxeno, ibuprofeno e os de uso tópico não esteroidais.

É permitido ao farmacêutico prescrever inibidores da bomba de prótons, antiácidos ou metoclopramida em casos de acidez estomacal, dispepsia ou desconforto gástrico.

É permitida ao farmacêutico a prescrição de antibacterianos de uso tópico para tratamento de acne vulgar e rosácea.

É vedada ao farmacêutico a prescrição de anti-histamínicos de primeira geração, como hidroxizina e dimenidrinato.