Uma das desvantagens dos sistemas transdérmicos é a possibilidade de irritação localizada ou reações alérgicas cutâneas.

Os surfactantes, como o docusato sódico, diminuem o fluxo através da pele.

Patologias cutâneas não influenciam a liberação do fármaco.

Não permite o controle da absorção de determinada quantidade do fármaco.