A Feema realiza o monitoramento da Baía de Guanabara em 13 estações de amostragem. Na bacia contribuinte são monitoradas trinta e oito (38) estações de amostragem, com o objetivo de acompanhar os principais indicadores físicoquímicos, biológicos e bacteriológicos, bem como a qualidade dos sedimentos e da biota. Esse monitoramento é realizado