Quanto à forma de governo, alguns inconfidentes desejavam a República centralizada, com um forte governo central que pudesse unificar as diversas capitanias; outros preferiam a Monarquia Federativa para harmonizar a diversidade de interesses das capitanias.

Com o intuito de obterem o apoio da opinião pública europeia ao movimento, os inconfidentes prometeram honrar os compromissos assumidos por Portugal para por fim ao tráfico africano.

Os inconfidentes pretendiam promover uma radical reforma na estrutura fundiária da colônia, com expropriação das grandes propriedades para assentamento da população pobre, inclusive de libertos.

Os inconfidentes tinham divergências em relação à escravidão. Alguns, inspirados nos ideais do iluminismo, desejavam dar alforria aos escravos, enquanto outros, alegando que sem escravos não haveria quem trabalhasse nas terras e nas minas, defendiam a manutenção da escravatura.

Em sua generalidade, os inconfidentes eram xenófobos e, por isso, não procuraram ajuda externa para o movimento.