O biomonitoramento não pode ser empregado como ferramenta de avaliação da saúde dos ecossistemas de rios em programas de gestão ambiental.

Biomonitoramento pode ser definido como o uso sistemático das respostas de organismos vivos para avaliação das mudanças ocorridas no ambiente, geralmente causadas por ações antropogênicas, o que permite a avaliação de possíveis danos ambientais.

O biomonitoramento não fornece informações relevantes em estudos que visem a redução de gastos aplicados em medidas de recuperação ambiental.

Bioindicadores são espécies taxonomicamente não-definidas, escolhidas por sua baixa sensibilidade a vários parâmetros, como, por exemplo, poluição orgânica ou outros tipos de poluentes.