Os principais vetores dessa tripanossomíase são os triatomíneos, insetos hematófagos endêmicos no País, mas são descritas outras formas, como, por exemplo, transfusional, congênita e oral.

A cardite chagásica é tipicamente granulomatosa, com focos nodulares e centros necróticos.

A formação de áreas estenóticas anulares por fibrose, secundárias à reação inflamatória ao parasito, explica o desenvolvimento de organomegalias digestórias na fase crônica em alguns dos pacientes.

O parasito não pode ser isolado das lesões compreendidas pelo sinal de Romaña.

O Tripanossoma cruzi é dimórfico, sendo possível observar aos cortes histológicos formas amastigotas nas lesões agudas e formas tripomastigotas nas lesões crônicas.