O ácido indol-3-acético é a principal citocinina de ocorrência natural. Ela é sintetizada principalmente através do triptofano. Os locais de biossíntese envolvem primariamente os primórdios foliares e folhas jovens, além de sementes em desenvolvimento.

As auxinas envolvem derivados de N6-adenina ou compostos de fenil uréia. A zeatina é a auxina mais comum em plantas. A biossíntese ocorre primariamente nos ápices radiculares.

O gás etileno é sintetizado a partir de giberelinas. Ele é sintetizado em tecidos em resposta ao estresse, especialmente em tecidos senescentes ou em amadurecimento.

O ácido abscísico é sintetizado a partir do ácido mevalônico. Ocorre em folhas maduras, especialmente em resposta ao estresse hídrico. Pode ser sintetizado em sementes.

O ácido giberélico é provavelmente a citocinina mais importante nas plantas. Ocorre em tecidos jovens dos ramos e em sementes em desenvolvimento.