A indução e a diferenciação da flor transcorrem durante o ano que precede a floração e frutificação.

Dentre os genes relacionados com o desenvolvimento floral da macieira, os de maior interesse são os genes MADS, que estão relacionados somente com a indução floral e sem ação na diferenciação e determinação da estrutura da flor, como sépalas, pétalas, estames e carpelos.

O início da indução floral da macieira ocorre, em geral, de 45 a 60 dias após a plena floração e a diferenciação da estrutura da flor no período de dormência.

A indução e diferenciação das gemas de flor transcorrem no mesmo ano de produção, logo após a poda de frutificação.

O potencial e a qualidade das gemas florais não diferem em função de sua localização na planta ou no tipo de ramo. Assim, gemas florais localizadas na região central e sombreadas da planta são semelhantes às demais, com flores e frutos maiores.