A trombose do seio cavernoso caracteriza-se pela colonização do seio cavernoso por bactérias da infecção odontogênica e ocorre porque as veias da região da cabeça e pescoço são avalvulares, possibilitando que as bactérias assumam uma via retrógada em direção ao SNC.

Segundo ARAÚJO (2007), este quadro pode ser diferenciado da síndrome do ápice orbitário devido a: