Segundo as diretrizes da American Heart Association a droga de escolha para o uso profilático de antibióticos é a amoxicilina, na dose de 50mg/kg, respeitando-se a dose máxima de 1g, 2 horas antes do procedimento.

Nos casos de abscesso ou celulite, o foco de infecção deve ser debelado (drenagem) para depois ser administrado o antibiótico. Nesse caso, o uso do antibiótico é considerado tratamento, portanto devem ser empregadas doses terapêuticas.

Na profilaxia, o antibiótico é administrado com a finalidade de atingir níveis sanguíneos e teciduais adequados no momento do procedimento, necessitando de continuidade em doses terapêuticas por mais pelo menos 5 dias.

Pacientes com defesa imunológica prejudicada por doenças como diabetes melito não controlado e AIDS não devem ter o uso profilático rotineiro dos antibióticos avaliado quando forem se submeter a procedimentos odontológicos invasivos.