a amostra é atravessada por um feixe de elétrons que trocam de lugar com os elétrons das camadas mais externas dos átomos, presentes na amostra biológica; essa troca de posição eletrônica libera energia na forma de calor, fazendo com que uma imagem térmica seja formada, a partir da amostra, com o auxílio de um programa específico.

nesta técnica, as imagens são formadas por sinais (elétrons secundários, elétrons retroespalhados, raios X, entre outros) coletados após a amostra ser “varrida” pelo feixe de elétrons.

um feixe de prótons é utilizado para atravessar a amostra e provoca a desestabilização do núcleo dos átomos dessa amostra; ocorre, então, a liberação de partículas pelo núcleo desses átomos, a energia das partículas é captada e medida, e a imagem é gerada com base nessas medições.

um laser de alta potência é transmitido através da amostra, corantes especiais são utilizados para maximizar as cores obtidas da amostra e um fotodetector recebe a imagem formada, transmitindo-a para um programa que a exibe em um monitor de computador.

um feixe de elétrons atravessa a amostra, podendo ser desviado pela interação com os agentes contrastantes presentes nessa amostra. Nesse caso, a imagem é formada por uma combinação de elétrons que alcançam e não alcançam o écran do microscópio.