Os PEs podem ser gerados apenas por estímulos táteis e sonoros, o que faz com que a técnica não possa ser utilizada na avaliação de integridade do nervo óptico.

A alteração de intensidade e frequência de estímulos sensoriais não são detectáveis nos potenciais evocados.

A separação do eletroencefalograma (EEG) e dos potenciais evocados pode ser realizada através do processamento dos sinais por média síncrona ou promediação, que consiste no cálculo da média dos sinais após várias estimulações.

Assim como no eletroencefalograma (EEG), a aquisição dos sinais de potenciais evocados pode ser realizada em toda a região do escalpo, independente do estímulo usado.

As interferências eletromagnéticas presentes em ambientes cirúrgicos não são uma preocupação no uso de potenciais evocados durante cirurgias, uma vez que a relação sinal-ruído (SNR) destes sinais é originalmente alta.