O ideal é que a entrada de água do viveiro seja construída em posição oposta à drenagem, para com isso facilitar a circulação da água, caso seja necessário realizar renovação da água.

O melhor sistema de drenagem é aquele que retira a água mais próxima ao solo, porque essa água, ao decorrer do cultivo, irá apresentando maiores concentrações de metabólitos, necessitando ser descartada.

A área e formato dos viveiros dependem da topografia do terreno, mas o ideal é que possuam formato mais próximo possível do quadrado, o que tornará o perímetro menor, facilitando a manutenção.

A profundidade dos viveiros interfere no manejo. Viveiros rasos propiciam aquecimento da água e também facilitam a proliferação de macrófitas aquáticas. Viveiros profundos podem apresentar zona afótica e piores condições para controle dos gases dissolvidos.