Para o adequado desempenho das atividades da farmácia hospitalar, os hospitais devem considerar exclusivamente a Relação Nacional de Medicamentos Essenciais (RENAME) como referência para a seleção de medicamentos.

Para o acompanhamento das principais atividades da farmácia em hospitais, recomenda-se a adoção de indicadores de gestão, logísticos, de assistência ao paciente e de educação.

Dentro da visão da integralidade do cuidado, a farmácia hospitalar deverá desenvolver atividades de distribuição e dispensação, manipulação e cuidado ao paciente, excetuando-se as ações assistenciais e técnico-científicas.

A implantação de um sistema racional de distribuição de medicamentos deve ser priorizada pelo estabelecimento de saúde e pelo farmacêutico, sendo recomendada a adoção do sistema coletivo de dispensação.

A manipulação magistral e oficial deve ser evitada, uma vez que a personalização da terapêutica acarreta considerável aumento de custos.