A serra do Mar e a serra Geral, representadas no mapa pela linha que corta o estado no sentido norte-sul, correspondem ao grande divisor de águas a partir do qual as bacias hidrográficas tomam a direção do litoral ou do interior.

A bacia hidrográfica de número 1, a maior da vertente do Atlântico, é periodicamente assolada por cheias que trazem enormes prejuízos e nela se concentra o maior parque industrial têxtil do estado.

Na bacia hidrográfica de número 5, as medidas ambientais protetoras dos mananciais e da cobertura vegetal, aliada ao processo de educação e ao tratamento dos esgotos, acabaram há décadas com o problema das enchentes em toda a área da bacia.

O litoral Sul de Santa Catarina, extremamente retilíneo a partir do farol de Santa Marta, em Laguna, até Torres (RS) foi recentemente assolado pelo inédito fenômeno atmosférico "Catarina".