Além do efeito da pressão dos fluidos intersticiais sobre o pericemento, a liberação de mediadores químicos e sua ação sobre as fibras nervosas dos tecidos periapicais explicam, em grande parte, a presença de dor intensa na pericementite apical aguda.

O quadro clínico denominado "flare up" quase sempre é devido a uma infecção da polpa que se segue à cárie, com as bactérias virulentas passando do interior do canal para o pericemento apical.

Em alguns casos, o granuloma pode ser encontrado ao longo da raiz, devido, principalmente, à presença de ramificações de grande calibre dos canais radiculares.

A cicatriz (escara) apical é caracterizada por uma área de reparo na área apical de dentes endodonticamente tratados, radiolúcida e não requer tratamento especial.