O FDG é levado ao cérebro pela corrente sanguínea e os pósitrons emitidos pelo ¹⁸F sofrem Bremsstrahlung no interior do paciente, e os detectores registram os raios X emitidos.

Os pósitrons atacam células do sangue que entram no cérebro, combatendo eventuais tumores em início de formação.

Os pósitrons emitidos pelo ¹⁸F sofrem aniquilação ao interagirem com elétrons locais no cérebro, com emissão simultânea de 2 fótons, que são detectados exteriormente.

As partículas β⁺ emitidas pelo FDG induzem reações nos núcleos de carbono existentes no cérebro, com produção de raios gama, que são detectados exteriormente.

A energia das partículas β⁺ é suficientemente grande para que elas, após a interação no cérebro, escapem do paciente e sejam detectadas exteriormente.