De acordo com o Cadastro Nacional de Unidades de Conservação, 8,1% do bioma Cerrado encontra-se protegido por Unidades de Conservação. Destas, 3,1% são de Proteção Integral e 5% de Uso Sustentável, principalmente Áreas de Proteção Ambiental - APA's - (4,9).

As Terras Indígenas correspondem a 4,4% da área do Bioma. O grupo das Unidades de Proteção Integral é composto pelas seguintes categorias de unidade de conservação, EXCETO.