Para exames de coprocultura, as fezes devem ser colhidas no início ou fase aguda da doença, quando os patógenos estão usualmente presentes em maior número e, preferencialmente, antes da antibioticoterapia. Se a amostra não puder ser entregue no laboratório em uma hora, o paciente ou familiar deve ser orientado para conservar em geladeira a 4 ºC, no máximo, por