as substâncias inorgânicas presentes no lodo sofrem reação química quando absorvidas pelas plantas, o que prejudica o crescimento do plantio e reduz os lucros do produtor.

as substâncias inorgânicas quando não absorvidas pelas plantas, podem, posteriormente, acumular-se na cadeia alimentar.

os coliformes termotolerantes enriquecem o solo e sua grande multiplicação pode prejudicar o crescimento dos demais micro-organismos benéficos às plantas.

os ovos de helmintos presentes no lodo consomem grande parte das substâncias inorgânicas, o que reduz a eficiência desse composto como fertilizante.

os metais pesados contidos no lodo não constituem elementos químicos utilizados pelas plantas, mas podem contaminar o recurso hídrico e constituir nutrientes para fauna.