A técnica mais comum consiste em imergir ou tocar os cortes montados na grade (ou tela) em uma gota da solução corante, colocada sobre uma placa de cera de dentista.

O tecido, tipo de resina em que está emblocado, o pH e a concentração da solução corante são fatores que determinam uma ótima contrastação.

O princípio da contrastação em microscopia eletrônica é a formação de produtos finais, contendo átomos leves, como carbono, chumbo, hidrogênio e urânio, visando aumentar o contraste dos constituintes celulares.

A contrastação pode ser realizada durante a fixação do espécimen (tetróxido de ósmio), durante a lavagem, durante a desidratação e nos cortes finos.