Os exames diretos são os testes mais utilizados na prática clínica para auxiliar na investigação da sífilis.

As colorações com prata e demais corantes histológicos possuem alta sensibilidade e especificidade para T. pallidum, além de serem técnicas mais complexas.

São testes treponêmicos disponíveis para o diagnóstico da sífilis: Imunofluorescência direta, ampliação de ácidos nucleicos (NAAT), testes rápidos e FTA-Abs.

Testes rápidos treponêmicos caracterizam-se, metodologicamente, como testes imunocromatográficos que permitem a pesquisa de anticorpos do tipo treponêmico em amostras biológicas.