a evolução da fase aguda é, em 90% dos casos, para a cura (espontânea ou medicamentosa).

a forma indeterminada é a mais frequente (cerca de 60% da população infectada).

são indicações para tratamento com benzonidazol: infecção pós-transfusional, a forma congênita, a por acidente em laboratório, por transplante de órgãos e na reagudização por uso de imunossupressores.

se considera “forma indeterminada” quando há, pelo menos, 2 reações sorológicas positivas para a doença, com estudo radiológico do coração, esôfago e cólon normais, além de ecg normal ou apenas com alterações clássicas (como brd+bdase).

na fase aguda da doença, as causas mais frequentes de óbito são a miocardite e a meningoencefalite.