Após cada procedimento cirúrgico, é preciso recolher os instrumentos utilizados e colocados em água fria com detergente ou solução enzimática, recolher os resíduos e roupa suja e colocar em recipientes adequados. Deve-se, também, limpar as mesas instrumentos e cirúrgicas quando necessário, e limpar o chão e debaixo do paciente se houver fluidos corporais.

Partículas no ar são fontes significativas de microrganismos e podem ser responsáveis por 80% a 90% da contaminação microbiana de uma ferida cirúrgica. Portanto, o tráfego para dentro e fora da sala de cirurgia é permitido desde que os cirurgiões estejam paramentados.

Alimentos e bebidas só são permitidos na área limpa do centro cirúrgico quando os procedimentos excederem o tempo de manutenção de glicemia normal de um adulto, considerado de 180 minutos.

Devido à rigorosa assepsia hospitalar, não é necessário isolar pacientes com microrganismos patogênicos.