A rejeição hiperaguda ocorre de minutos a dias após o transplante, é mediada por anticorpos previamente existentes e é evitada com testes de compatibilidade das células do doador com o soro do receptor.

A rejeição aguda é mediada por linfócitos B, pode ocorrer de dias a meses após o transplante e é a única que pode ser revertida com imunossupressão.

A rejeição crônica normalmente ocorre anos após o transplante, é um processo que envolve fibrose do enxerto e o principal fator de risco é a presença de rejeição aguda prévia.

A imunossupressão do transplante é dividida em terapias de indução e manutenção, sendo a primeira mais agressiva e com risco aumentado de infecções oportunistas ou malignidades como o linfoma.

A imunidade inata é mais reativa a um órgão isquêmico do que a um órgão transplantado de um ser da mesma espécie.