O HIV-2 infecta preferencialmente os linfócitos T CD8+, enquanto o HIV-1 infecta os linfócitos T CD4+.

O HIV-2 induz uma resposta imune celular mais robusta, controlando a replicação viral de forma mais eficaz que o HIV-1.

A progressão para AIDS é mais rápida na infecção por HIV-2, com maior risco de desenvolvimento de doenças oportunistas.

A carga viral do HIV-2 é geralmente menor que a do HIV-1, e a taxa de progressão para AIDS é mais lenta.

HIV-2 não causa depleção de linfócitos T CD4+, preservando a imunidade celular do paciente.