A coleta do material deve ser feita em três amostras colhidas em dias diferentes, pois a ausência de parasitas em uma amostra de fezes não descarta a possibilidade da presença do mesmo no organismo.

O exame de esfregaço a fresco pelos métodos diretos não permite visualizar os estágios de diagnóstico dos protozoários (trofozoítas e cistos) e dos helmintos (ovos, larvas e pequenos adultos).

O exame indireto por material fixado em formol é um procedimento simples e eficiente para o estudo das fezes, permitindo observar todas as formas dos protozoários e jamais deve ser omitido.

O uso de soluções salina e de iodo, nos esfregaços com fezes frescas e não fixadas, deve ser evitado por razão da possível alteração do material a ser observado.