Uma desvantagem da propagação vegetativa é a possibilidade de se estabelecer lavouras com 100% de plantas de sexo desconhecido.

A produção de sementes pelos próprios agricultores requer cuidados especiais e seria aconselhável apenas àqueles que detenham conhecimento sobre a cultura.

O uso de estacas obtidas a campo pode trazer outro inconveniente ao processo de propagação clonal que é a retirada de estacas doentes, sobretudo a meleira e o mosaico.

A enxertia propriamente dita se caracteriza pela junção dos tecidos de duas plantas, entre a parte de cima denominada epibioto (“garfo”, enxerto ou “cavaleiro”) sobre a parte de baixo o hipobioto (porta-enxerto ou “cavalo”) de outra cultivar ou espécie.